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Archive for February, 2011

Sagrada Família

I mean the big Gaudí church in Barcelona, whose official name I can’t not include: Basílica i Temple Expiatori de la Sagrada Família. Words are entirely inadequate to describe it, as are pictures. That isn’t stopping me, but what’s on offer here is a poor substitute for standing inside it with eyes wide.

It was a brutal day; raining and blowing hard and not much above 10°C; a weekday too, and thus no line-ups to get in, which I gather is unusual.

I remember as a kid staring for a long time at a picture (perhaps in Life magazine?) of one of its facades, which at that time was about all that was standing. It was only a quarter done when Gaudí died in 1926 and what with wars and Fascism and so on the work has often lagged. Now it’s in steady progress; the interior was good enough to be consecrated just a couple of months ago, and there’s a good chance it’ll be complete in my lifetime.

The aesthetic of the exterior facade is idiosyncratic verging on grotesque; it’s really hard not to consider it overdone. It is however, like every other part of the church, entirely confident.

A facade of Sagrada Familia in BarcelonaInside, the space is vast beyond imagining, a peer of Europe’s other great Gothic poems in stone (although this a church not a cathedral). It’s hard to capture space on this scale in a picture, but the spiral staircase here helps a bit, I think.

Sagrada Familia, interior with spiral staircaseIt’s still under active construction. You can see the stonecutters at work, and while we were there a pair of engineers were sighting with some scope-equipped measuring tool from near the altar to way up at the top back, taking notes and talking them over.

The whole inside, much of it very freshly built, is white and pristine to a degree disconcerting to those like me who in touring many of the world’s best-known pieces of ecclesiastical architecture have come to expect centuries’ worth of accumulated surface grunge.

Sagrada Familia, interior with columns and pillarsLet’s come right out and say it: this architecture is kind of weird. It doesn’t look like anything. Quite a bit of twentieth-century architecture looks like it; in particular quite a bit of extremely bad sixties and seventies work. I’m actually not 100% sure I like it. But it doesn’t care what I think. It is utterly confident in its design and execution, not trying to be anything but what it is, quoting effortlessly from the Gothic vocabulary in the shape of the enclosed space, which space however is wrapped by insanely-huge Ionic columns and decorative flourishes that might as well be from Mars.

Here’s a view straight up from more or less at the center of the nave.

Sagrada Familia, dead center looking upMy feelings about this are obviously complex and I think they would be even if I believed generally in the Deity this exists to serve or even particularly in the deep Catholic weirdness the symbology on every wall and window is pushing in your face.

Here we stand in front of the altar, looking up.

Sagrada Familia, looking up over the altarI’m so glad Gaudí convinced whoever picks major church designs to pick his. I’m so glad I was there and saw it. I’m totally going back once it’s finished if I have the good fortune to be alive then.

 


¿Transferencias laterales o genomas contaminados?

Más del 20 por ciento de las secuencias genómicas de no primates de las principales bases de datos están contaminadas con ADN humano. El estudio, llevado a cabo por un equipo de la Universidad de Connecticut encabezado por Mark Longo, se publica en PLoS ONE. Este resultado vuelve a señalar la importancia tanto de las medidas de prevención de la contaminación a la hora de secuenciar genomas como del control de la contaminación potencial en los genomas tomados de las bases de datos públicas.
Hace unos días se ha formado un revuelo en distintos ámbitos científicos por la publicación de un informe en mBio en el que se afirmaba haber detectado una transferencia horizontal de genes entre los humanos y gonorrea, con las implicaciones que ello tiene desde el punto de vista evolutivo (más información aquíaquíaquí). ¿Podríamos estar ante un caso de contaminación de los datos por ADN humano?
La contaminación puede llegar a una secuencia genómica en varias de las fases de la secuenciación. Podría provenir de bacterias que transporte el aire y que aterricen en la muestra, o incluso fragmentos de ADN que se hayan quedado en los reactivos tras la esterilización. Pero probablemente la fuente de contaminación más común sea el propio científico. Sólo hace falta que una célula de la piel caiga en una muestra antes de la amplificación.
Mark Longo estaba buscando secuencias conservadas en las bases de datos de genomas y encontró que, sorprendentemente, había secuencias que se repetían en distintas especies. Sin embargo, no pudo replicar los datos en el laboratorio en ningún caso, lo que sugería que los genomas de las bases de datos podían estar contaminados. Vistos los resultados, a continuación decidió comprobar todos los genomas de no primates conservados en cuatro bases de datos públicas, en concreto las ubicadas en: la Universidad de California en Santa Cruz, el GenBank del Centro Nacional para la Información Biotecnológica, el Instituto Genómico Conjunto y Ensembl (los cuatro centros están en los Estados Unidos). Buscó específicamente secuencias repetitivas humanas conocidas como elementos AluY.
De las 2.057 secuencias comprobadas, 454 contenían esta secuencia de ADN humano, el 22%, un nivel de contaminación como para preocuparse. Y esta es sólo la contaminación de fuentes humanas, ¿cuanta habrá de otras especies comunes en los laboratorios como E. coli? [Los pocos (falsos) positivos de presencia de E. coli en alimentos en el laboratorio de la empresa del que esto escribe han resultado ser contaminaciones de las muestras por manipulación inadecuada durante su toma y/o su preparación para la PCR]
Esta frecuencia de contaminación humana hace que se hagan imprescindibles mayores controles de calidad, lo que implica recomprobaciones de secuencias para confirmar los resultados. Pero también significa mayores problemas en los estudios de las secuencias humanas: encontrar un elemento Alu humano en el genoma de un pez es fácil, encontrar una contaminación humana en una muestra humana no es tan sencillo.
Por si alguien duda de la importancia de la calidad de los datos, imaginemos que alguien tuviese que tomar decisiones sobre la salud de una persona basándose en su genoma sabiendo que tiene una probabilidad del 20% de que los resultados estén contaminados.
Referencia:

Longo, M., O’Neill, M., & O’Neill, R. (2011). Abundant Human DNA Contamination Identified in Non-Primate Genome Databases PLoS ONE, 6 (2) DOI: 10.1371/journal.pone.0016410

 


WordPress 3.1 “Reinhardt” disponible para descarga

Ya se encuentra disponible para descarga la versión final deWordPress 3.1, en la que se han incorporado una serie de mejoras y se han solucionado alrededor de 820 bugs heredados de las versiones anteriores.

WordPress se ha convertido en uno de los CMS (Sistema de Gestión de Contenidos por sus siglas en inglés) más utilizados a nivel mundial, siendo un proyecto de software libre creado por Matt Mullenweg y que es desarrollado utilizando PHP y MySQL bajo licencia GPL.

Dentro de las novedades incorporadas en WordPress 3.1 “Reinhardt” (en honor al guitarrista de jazz Django Reinhardt) se cuenta la incorporación de un rediseñado sistema de enlaces que busca facilitar el enlazado de páginas y notas ya existentes, sumado a una nueva interfaz de escritura mucho más limpia de manera de hacer más grata la ardua tarea de escribir nuevas notas.

 

Además de las novedades descritas anteriormente, algunas de las nuevas características incorporadas en WordPress 3.1 son:

  • Barra de admin: Contiene varios enlaces para acceder a diversas pantallas de administración. Por defecto, la barra de admin se muestra cuando un usuario ha accedido y está visitando el sitio, y no se muestra en las pantallas de administración en las instalaciones simples (sin multisitio activado). Para las instalaciones con multisitio se muestra tanto cuando estás visitando el sitio como en las pantallas de administración
  • Mejoras en la interfaz de escritura: Los nuevos usuarios de WordPress encontrarán la pantalla de escritura mucho más limpia que antes, con la mayoría de las opciones ocultas por defecto
  • Formatos de entrada: La información de los formatos pueden usarla los temas para personalizar la presentación de una entrada
  • Administrador de la red: Se han movido los menús del Super administrador y las páginas relacionadas de la pantalla de admin habitual a la nueva Pantalla de administrador de la red
  • Pantallas de administración en modo de lista: Puedes ordenar las columnas de las pantallas con listados (páginas, entradas, comentarios, etc) para mejorar la paginación
  • Mejoras del exportador/importador: Hay muchos cambios en la información del autor, mejora en el manejo de taxonomías y términos, soporte correcto de menús de navegación, etc.
  • Mejoras en el tipo de contenido personalizado: Permite a los desarrolladores crear páginas de archivo y disponer de más controles de las capacidades y mejores menús
  • Consultas avanzadas: Permite a los desarrolladores realizar consultas múltiples de taxonomías y campos personalizados.
  • Un esquema de color azul para la administración más fresco que centra la atención en tu contenido

Para quienes deseen conocer la lista completa de cambios introducidos en la versión 3.1 de WordPress lo pueden hacer en el enlace al final de la nota.

Link: Version 3.1 (WordPress Codex)


 


Despiezados

Cualquier “loco” de las máquinas ha hecho cosas así en alguna ocasión. Recuerdo que, de pequeño, tenía la manía de desmontar hasta la última pieza relojes antiguos. Luego intentaba volver a montarlos y que funcionaran pero, como puede imaginarse, los primeros intentos fueron un desastre. Hoy visita TecOb una obra de arte de esas que me gusta compartir porque a su parte estética se une el que los protagonistas son máquinas y, claro, se convierte en algo irresistible. He aquí el Disassembly project, donde máquinas cotidianas son diseccionadas y sus piezas ordenadas meticulosamente por Todd McLellan | Vía Core77 |

Como muestra, tres ejemplos: una máquina de escribir, una cámara fotográfica analógica y un viejo radio-reloj. Para ver el resto de la colección, lo mejor es entrar en la web de McLellan y pinchar en la sección “New Work” (Necesita Flash).

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Si funciona, no lo toques

Cuando un celacanto, un tipo de pez con las aletas lobuladas y que una vez se consideró una especie intermedia en la evolución de los peces a los anfibios, apareció en las redes de unos pescadores en 1938 vivito y coleando fue una conmoción para los paleontólogos. Hasta entonces las trazas más recientes que se tenían de un animal así aparecían en rocas que databan de una época en la que los dinosaurios todavía poblaban la Tierra, hace 65 millones de años. Fue como visitar Teruel y en vez del “Torico”  toparse con un Tyrannosaurus rex dando dentelladas. Ahora está pasando lo mismo pero al revés: en vez de encontrar vivo lo que se creía que sólo era un fósil, han encontrado un fósil que es idéntico a una especie actual.
El fósil en cuestión, un espécimen de 100 millones de años de antigüedad del noreste de Brasil, pertenece al género Schizodactylus. A este genero pertenecen insectos grandes, carnívoros y con aspecto de grillo cuyos patas se extienden en todas direcciones. Los Schizodactylus actuales usan sus pies como si fueran raquetas de nieve, lo que les permite moverse por los terrenos arenosos en los que viven en busca de sus presas.

Si el nuevo fósil, cuyo estudio detallado ha sido publicado en ZooKeys por Sam Heads (INHS, Estados Unidos) y Léa Leuzinger (U. Friburgo, Suiza), fuese simplemente parecido a las insectos actuales de pies extendidos el descubrimiento no habría sido especialmente sorprendente: simplemente sería un ejemplo más de estasis evolutiva, es decir, una característica que se mantiene a lo largo del tiempo. Lo que es sorprendente es lo estático que ha sido Schizodactylus.
La estasis evolutiva es bastante común en los niveles de clase, orden y familia del sistema linneano de clasificación. Una vez que la selección natural da con un buen diseño, este diseño se adopta con pequeñas modificaciones especie tras especie. Los cuerpos acorazados de las tortugas, por ejemplo, evolucionaron hace entre 250 millones y 200 millones de años, mientras que la estructura del cuerpo de los escorpiones se mantiene desde hace más de 400 millones de años. Esto no significa que un zoólogo vaya a confundir una tortuga de 200 millones de años  o  un escorpión de 400 millones con cualquier especie viva hoy día.
Lo que es llamativo de este fósil es que es tan similar a los animales actuales que puede ser clasificado en un género actual (el nivel más bajo de clasificación linneana por encima de especie) en vez de en un grupo taxonómico superior. Esto sí que es raro de verdad. Incluso el celacanto actual, después de ser estudiado en detalle, tuvo que ser ubicado en un género diferente al de cualquier fósil conocido.
Parece evidente que la estructura del cuerpo de Schizodactylus no es que sea buena, es que es óptima, al menos para el entorno en que el animal vive.  Los desiertos arenosos en los que prefiere vivirSchizodactylus han desaparecido del noreste Brasil, pero el hallazgo de este fósil muestra mejor que ninguna otra prueba cómo era esta zona hace 100 millones de años. Pero su hallazgo ilustra perfectamente algo mucho más importante, la primera regla de la selección natural: “si funciona, no lo toques”.
Referencia:

Heads, S., & Leuzinger, L. (2011). On the placement of the Cretaceous orthopteran Brauckmannia groeningae from Brazil, with notes on the relationships of Schizodactylidae (Orthoptera, Ensifera)ZooKeys, 77 DOI: 10.3897/zookeys.77.769

 


¿Podría un gato sobrevivir a una caída desde un rascacielos?

gato-volador1.jpg

La sabiduría popular lo tiene claro: los gatos tienen siete vidas, y además, aunque caigan desde mucha altura, siempre lo harán a cuatro patas, grácilmente. Pero ¿hasta qué punto esto es así?

Parece razonable pensar que un gato pueda sobrevivir a una caída de un piso, Incluso de dos. Pero ¿y a una caída de, por ejemplo, 32 pisos?

En un artículo titulado “El síndrome del edificio alto en los gatos”, publicado en 1987 en el Journal of the American Veterinary Medicine Association, se estudiaban las heridas y los índices de mortalidad de los felinos que habían sido trasladados al hospital tras una caída que oscilaba entre las 2 y las 32 plantas.

El índice de supervivencia era del 90 %.

Pero lo más llamativo era que, si bien la incidencia de heridas y de muerte alcanzaba su punto máximo en la planta número 7, a medida que se incrementaba la altura de la caída… entonces la mortalidad disminuía.

Esto sucedía a causa de tres variables principales que determinaba el índice de lesiones y de mortalidad: la velocidad adquirida, la distancia a la que el gato se ve obligado a parar y la zona del gato sobre la que se extiende la fuerza de parada.

El gato que cae tiene un área superficial superior a la proporción de masa de un humano que cae, y alcanza por tanto una velocidad terminal de unos 100 km por hora (aproximadamente la mitad que los humanos). Son capaces también de girarse de forma que el impacto se extienda por sus cuatro patas, en vez de por nuestras dos piernas. Y como son más flexibles que los humanos, pueden aterrizar con las extremidades flexionadas y difundir la fuerza del impacto a través del tejido blando.

¿por qué aumenta la supervivencia del gato más allá de los 7 pisos de altura? Existe una hipótesis al respecto: el gato se pone tenso a medida que acelera, lo cual reduce su capacidad de absorción del impacto. Pero si se cae de mayor altura, tiene tiempo de alcanzar su velocidad terminal (deja de acelerar), con lo cual el gato se relajará un poco más (todo lo que pueda relajarse un animal que observa que está cayendo en picado desde una altura descomunal), aumentando así su flexibilidad y el área de la sección transversal sobre la que el impacto se difunde.

Cuando un gato aterriza, dobla las patas para absorber el impacto como hacemos nosotros con las rodillas. Esa acción empujará evidentemente el cuerpo hacia el suelo, sobre todo la cabeza, gracias a que tiene cuatro patas. Por encima de cierta altura, esta acción de doblarse pondrá la barbilla en contacto con el suelo y por eso los gatos que caen o saltan desde una gran altura impactan con fuerza en el suelo y se destrozan la mandíbula.

Es por ello que los veterinarios acostumbran a atender a gatos con lesiones en la mandíbula.

Así describí el biólogo J. B. S. Haldane en 1927 los riesgos de diferentes animales al precipitarse desde las alturas, en Mundos posibles y otros ensayos:

Una rata muerte, un hombre queda destrozado, un caballo revienta. Pues la resistencia que ofrece el aire al movimiento es proporcional a la superficie del objeto que se mueve. Divide la longitud, la anchura y la altura de un animal por 10 cada una; el peso se reduce a una milésima, pero la superficie sólo a una centésima. Así que la resistencia a la caída en el caso del animal pequeño es comparativamente diez veces mayor que la fuerza impulsora. Por tanto un insecto no teme a la gravedad; puede caer sin peligro y puede aferrarse al techo sin demasiado problema.

Vía | ¿Hay algo que coma avispas? de Mick O´Hare

 


Sensores infrarrojos

Imagen infrarroja

Hoy vamos a hablar sobre los sensores infrarrojos, que además de ser útiles para medir temperatura y detectar objetos calientes, nos permiten visión nocturna y la posibilidad de atravesar algunos objetos opacos para la luz visible.

Estos sensores poseen multitud de aplicaciones como por ejemplo, vigilancia de objetos y personas, medida de temperaturas remotas en aplicaciones industriales, detección de fugas de calor, monitorización y detección de incendios, y diferentes aplicaciones científicas y médicas.

La banda del infrarrojo va desde los 0.75 hasta los 1000 um (nanómetros), y podemos diferenciar las siguientes bandas:

– IR cercano: 0.75 a 3um.

– IR medio: 3 a 6um.

– IR lejano: 6 a 15um.

– IR extremo: 15 a 1000um.

El sensor infrarrojo se basa en la emisión de cuerpo negro ideal, es decir, un cuerpo que absorbe y reemite toda la radiación incidente, independientemente de la longitud de onda que sea. Ya que esta situación es ideal, se trabaja con una aproximación de cuerpo negro, donde la radiación incidente no sólo se absorbe, también se refleja y se transmite

Ecuación radiación

donde alpha indica la reflectancia, rho la absorción y tau la transmitancia del objeto. Por ejemplo, un espejo perfecto posee un factor de absorción igual a uno, ya que refleja toda la radiación incidente, mientras que un cuerpo opaco no tiene transmitancia y toda la radiación bien se absorbe o se refleja.

Existen varios tipos de detectores infrarrojos. El más común es el térmico, que se basa en que la radiación se transforma en calor. También existen los detectores cuánticos, que aplican que la radiación cambia el estado cuántico del material. Ambos detectores suelen necesitar refrigeración para mejorar la relación señal ruido y obtener mejores resultados.

Por otro lado tenemos las cámaras infrarrojas, que utilizan matrices de detectores para obtener la imagen (existe una relación lineal entre la salida del detector y el valor de pixel), los pirómetros que ofrecen una medida puntual y los escáneres de línea, que obtienen la medida de una línea del campo de visión y completan la imagen con un barrido en el tiempo.

En función de la aplicación, se distingue entre cámaras termográficas, pensadas para medir temperatura, y cámaras térmicas, pensadas para un estudio cualitativo, donde es importante la resolución y el contraste pero no tanto la precisión.

Los rangos de estas cámaras van desde los 3-5 um para temperaturas entre 600-1000 grados Centígrados (detección temprana de incendios) y los 8-12 um para la monitorización de incendios de bajo coste u objetos más fríos. Por último cabe destacar que también existen cámaras para infrarrojo reflejado (< 3um)

Vía | Sensores infrarrojos. Joaquín Ferruz Melero.

 


Esto es lo que se demora un hacker en descifrar tu contraseña

Pensar contraseñas es una tarea difícil y a veces se nos ocurre la estúpida idea de usar passwords como123456 QWERTY. En realidad si tienes uno de esos dos eres una vergüenza de internet.

Pero otras claves un poco más largas también pueden ser frágiles. O así por lo menos lo deja claro este cuadro, que revela cuánto puede tomarle a alguien descifrar tu clave dependiendo de la complejidad que tiene. Así que ya saben, no le hagan la tarea fácil a quienes quieren apropiarse de tus datos…

LinkBusinessWeek (vía Geekologie)


 


FMP – Im Rückblick / In Retrospekt (FMP, 2010)

By Stef

While in Munich, Germany, ECM celebrates its 40th anniversary with the publication of a great catalogue in Japan, up in Berlin, in the north of the country, FMP (Free Music Produktion), equally celebrates its 40th anniversary with an impressive 3.5 kg 12 CD box and a 218 page book.

If ECM stands at the cradle of sophisticated post-bop, with impressionistic and often sentimental leanings, with music that often appeals to broader audiences, FMP stands for the other bifurcation in the jazz road, the one of free improvisation, often wild and harsh and uncompromising, delving deep into the expressive possibilities of sound, be it by solo musicians or improvising big bands such as the Globe Unity Orchestra, often more authentic, more revolutionary in nature than the colleagues of the south. If ECM innovates within our sonic comfort zone, FMP innovates outside of our sonic comfort zones. Of course, like every comparison, this one is also flawed, as many musicians appear on both labels: Dave Holland, Arild Andersen, Marion Brown, Jon Christensen, Marylin Crispell, … and this is just the beginning of the alphabet.

But FMP will carve out its position in music history with musicians such as the great Germans Peter Brötzmann, Alexander von Schlippenbach, Rüdiger Carl, Urs Leimgruber, Ulrich Gumpert, Günter “Baby” Sommers, Peter Kowald, at that time already building bridges between East and West Berlin, through music, creating the European – German – side of jazz and free improvisation : a little less entertaining than American jazz, more cerebral, angrier, dissatisfied, but exploring and exploring for new sounds for a new world.

They built bridges to the other musicians in Europe and in the US, with names such as Evan Parker, Han Bennink, Micha Mengelberg, Fred Van Hove,  Steve Lacy, William Parker, Butch Morris, Bill Dixon, Cecil Taylor, … joining ideas, making them bounce and interact in new creative avenues.

The book describes it all : the history, an overview of all concerts and workshops, the entire catalogue with cover art, musicians and recording dates, …  a real treasure trove for the fan.

The box comes with 12 CDs, of which most have been released before with the exception of CD1, CD 8, CD 9, CD 10, CD 11 and CD 12, and the entire collection gives a great idea of the span of the FMP catalogue.

I believe the number of boxes was limited to 1,000 copies, but all CDs can be purchased separately. And trust me, many – if not all – of these CDs are must-haves. The ones I enjoyed the most are Globe Unity Orchestra, Peter Kowald solo, Schlippenbach Quartet, Die Like A Dog, Steve Lacy solo.

Buy from Instantjazz.

© stef

 


¿Está el iPod Classic en peligro de extinción?

Es difícil pensar ya en un iPod y que no venga a la mente el iPod Touch. La sensación general es que el iPod Classic está en decadencia y la ausencia de stock en las tiendas online de Apple o en grandes cadenas son un aliciente más que invita a pensar que podríamos estar ante la última generación de este modelo.

También se está alargando extrañamente los tiempos de reparto a través de la web de Cupertino, que pasaron de ser 24 hora a 3 días y ahora son dos semanas. De hecho ya en la reciente renovación de la gama iPod el propio Steve Jobs dijo que los había renovado todos ignorando el modelo Classic, lo que nos hizo pensar quesu final estaba cerca.

Ante esto nos queda pensar que o bien estamos ante una actualización del modelo -cosa extraña viendo la fecha que es y la “cercanía” de la renovación del resto de modelos- o, por el contrario, podríamos estar viendo el principio del fin de este histórico reproductor musical. ¿Qué opción te parece más factible?